Microbiome
Le microbiome joue un rôle essentiel dans de nombreux domaines de recherche, de la santé humaine à l’environnement. Les solutions Precellys et Coriolis permettent d’optimiser chaque étape du workflow, depuis l’échantillonnage des micro-organismes présents dans l’air jusqu’à l’homogénéisation efficace des échantillons complexes afin de garantir une caractérisation précise des communautés microbiennes.
Analyse du microbiome
Un profilage microbien précis commence par une préparation d’échantillon adaptée
L’analyse du microbiome vise à caractériser des communautés microbiennes complexes à partir d’échantillons tels que les selles, les aliments, les sols ou d’autres matrices environnementales.
Une lyse microbienne efficace et non biaisée est essentielle pour obtenir un ADN ou un ARN représentatif destiné aux analyses en aval.
Les homogénéisateurs Precellys®, associés à des kits de lyse dédiés, permettent une lyse efficace et reproductible d’un large éventail de micro-organismes, même à partir d’échantillons complexes.
Le défi : obtenir une lyse microbienne représentative
Réduire les biais de lyse
Les échantillons de microbiome contiennent des micro-organismes présentant des propriétés de paroi cellulaire différentes. Si la lyse est incomplète, certaines espèces peuvent être sous-représentées dans le profil microbien final.
S’adapter aux échantillons complexes
Les micro-organismes peuvent être libres en solution ou intégrés dans des matrices complexes telles que les selles, les sols, les aliments ou d’autres échantillons environnementaux.
Standardiser la préparation des échantillons
Une homogénéisation reproductible est essentielle pour réduire la variabilité entre les échantillons et améliorer la qualité des données obtenues lors des analyses en aval.
Choisir la bonne matrice de lyse
Les différents types de micro-organismes et d’échantillons peuvent nécessiter des tailles et des matériaux de billes spécifiques afin d’assurer une disruption efficace.
Les solutions Precellys
Une lyse microbienne efficace grâce à la technologie de broyage par billes 3D
Les homogénéisateurs Precellys utilisent une technologie de broyage par billes en mouvement 3D permettant une disruption mécanique rapide et reproductible des micro-organismes.
Associé à des kits de lyse dédiés et à des protocoles optimisés, Precellys s’adapte à différentes communautés microbiennes et matrices complexes avant l’extraction d’ADN ou d’ARN.
Des kits de lyse dédiés aux applications microbiome
Choisissez le kit d’extraction adapté à votre type d’échantillon afin de garantir une disruption microbienne efficace et représentative.
| Votre défi | Solution Precellys |
|---|---|
| Lyse générale des micro-organismes | VK01 / VKMix |
| Lyse des micro-organismes difficiles | VK05 |
| Micro-organismes présents dans les tissus | SK38 |
| Lyse bactérienne | CK01 |
Surveillance microbiologique de l’air
Collecte fiable de bioaérosols pour des recherches environnementales et sanitaires
Les micro-organismes aéroportés et les contaminants biologiques peuvent impacter la santé publique, la qualité de l’air intérieur et la sécurité environnementale. Qu’il s’agisse de surveiller des agents pathogènes tels que la Legionella, de caractériser les communautés microbiennes aéroportées via la métagénomique, d’évaluer l’exposition aux endotoxines ou d’étudier des micro-organismes dans des conditions environnementales difficiles, un prélèvement efficace de l’air est la première étape vers une analyse fiable.
Les échantillonneurs d’air Coriolis® utilisent une technologie de collecte de bioaérosols liquide combinée à des débits d’air élevés pour capturer efficacement les micro-organismes en suspension dans l’air, les particules biologiques et les sous-produits microbiens. Compatible avec des méthodes en culture et moléculaires, Coriolis® prend en charge un large éventail d’applications de microbiologie environnementale et de surveillance des bioaérosols.
Le défi : collecter des échantillons biologiques représentatifs en suspension aérienne
Capture de faibles concentrations de bioaérosols
Les micro-organismes aéroportés et les contaminants biologiques sont souvent présents à très faibles concentrations, nécessitant un prélèvement d’air à grand volume pour garantir une récupération suffisante pour une analyse en aval.
Maintenir la compatibilité des échantillons
Les échantillons collectés doivent rester adaptés à la culture, à la PCR, à la qPCR, au séquençage, à la métagénomique et à d’autres techniques de laboratoire sans compromettre l’intégrité biologique.
Évoluer dans des environnements difficiles
La surveillance environnementale peut être réalisée dans des endroits à forte humidité, à températures variables ou à atmosphères fortement contaminées, nécessitant des performances d’échantillonnage robustes et fiables.
Les Solutions de Coriolis
Collecte efficace de bioaérosols liquides
Les échantillonnages d’air Coriolis combinent des débits d’air élevés avec une technologie de collecte de liquides cycloniques pour maximiser la récupération des micro-organismes et des particules biologiques en suspension dans l’air. Leur production liquide simplifie le traitement des échantillons et offre une compatibilité avec un large éventail d’analyses microbiologiques, moléculaires et environnementales.
Solutions éprouvées pour les études de microbiologie aéroportée
Choisissez l’application Coriolis appropriée selon votre objectif de surveillance.
| Votre défi | Application de Coriolis |
|---|---|
| Caractérisation du microbiome aéroporté | Analyse métagénomique des communautés microbiennes aéroportées |
| Surveillance des agents pathogènes aéroportés | Détection de Legionella et d’amibes libres |
| Évaluation de la qualité de l’air intérieur | Détection des endotoxines dans les environnements de bureau |
| Prélèvement dans des conditions environnementales difficiles | Surveillance des bioaérosols dans des environnements à forte humidité |
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