Chaque année, le 5 juin, le monde entier célèbre la Journée mondiale de l’environnement, une initiative des Nations Unies visant à sensibiliser et à encourager l’action pour la protection de notre planète. Forêts, océans et espèces sauvages occupent souvent le devant de la scène, mais un aspect essentiel de la biodiversité reste invisible : les micro-organismes.
Le microbiome : le côté invisible de la nature
Les microbes, bactéries, archées, champignons et virus sont indispensables à la vie sur Terre. Ils favorisent la croissance des plantes, régulent les écosystèmes, recyclent les nutriments et contribuent même à atténuer le changement climatique. Pourtant, parce qu’ils sont invisibles à l’œil nu, leur rôle est souvent sous-estimé. Comprendre la diversité microbienne est essentiel pour dresser un tableau complet de la santé des écosystèmes.
Pourquoi la préparation des échantillons importe en recherche environnementale
Pour étudier le monde microbien avec précision, les chercheurs ont besoin de plus que de simples technologies de séquençage. Tout commence par la manière dont l’échantillon est préparé. Les micro-organismes présentent des structures et des résistances très variées ; une mauvaise lyse peut biaiser ou tronquer les résultats.
C’est là que l’homogénéisation devient cruciale. Partout dans le monde, les homogénéisateurs Precellys et Minilys de Bertin Health & Life Sciences sont utilisés pour :
- assurer une lyse complète et uniforme des cellules microbiennes
- préserver l’intégrité de l’ADN et de l’ARN
- obtenir des résultats reproductibles sur une grande diversité d’échantillons environnementaux
Sans préparation de haute qualité, l’image microbienne reste incomplète.
Trois études réelles sur les microbes de l’environnement
Voici trois exemples d’études mettant en lumière la diversité microbienne dans l’esprit de la Journée mondiale de l’environnement :
Mécanismes d’adaptation au froid chez les bactéries antarctiques
Dans les conditions extrêmes de l’Antarctique, des chercheurs ont analysé comment des bactéries survivent en dessous de zéro. Grâce à l’homogénéisateur Precellys, ils ont extrait de l’ARN de haute qualité pour décrypter les stratégies génétiques de résistance au froid.
Étude du microbiote intestinal chez les abeilles
Pollinisateurs essentiels, les abeilles jouent un rôle crucial dans la biodiversité et la sécurité alimentaire. Les scientifiques ont utilisé le Minilys et des kits à billes céramiques pour analyser le microbiote intestinal des abeilles, révélant comment ces communautés microbiennes soutiennent la santé et la résilience des colonies.
Détection de co-infections chez les tiques roumaines
Les tiques comme Ixodes ricinus peuvent héberger plusieurs pathogènes, compliquant diagnostic et traitement. En Roumanie, des chercheurs ont employé le Precellys 24 pour extraire à la fois de l’ADN et de l’ARN de tiques prélevées sur le terrain, identifiant Borrelia burgdorferi et d’autres bactéries co-infectantes pour mieux comprendre leurs impacts sur la santé publique.
Alors que nous faisons face au changement climatique, à la perte de biodiversité et à la dégradation de l’environnement, la biodiversité invisible doit être intégrée à la conversation. Les microbes peuvent être petits, mais ils détiennent des informations essentielles sur le fonctionnement et la résilience de nos écosystèmes.
